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後基因組時代魚類樣本庫建設與實踐


孫穎,石瓊編 著



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发表于2024-11-16

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店鋪: 科學齣版社旗艦店
齣版社: 科學齣版社
ISBN:9787030511690
商品編碼:12125566847
包裝:平裝
開本:16
齣版時間:2017-01-01
頁數:190
字數:282000

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後基因組時代魚類樣本庫建設與實踐
曾用價 88.00
齣版社 科學齣版社
版次 1
齣版時間 2017年01月
開本 16開
作者 孫穎,石瓊 編
裝幀 平裝
頁數 190
字數 282000
ISBN編碼 9787030511690


內容介紹
  《華大基因-國傢基因庫係列:後基因組時代魚類樣本庫建設與實踐》圍繞魚類樣本庫建設這個中心論點,迴答為什麼(魚類種質資源保存和利用)、現狀如何(國內外現狀及現今的挑戰和機遇)、怎樣做(標準規範和實踐)、怎麼用(配套數據庫)等幾個關鍵性問題,囊括魚類樣本庫建設的幾乎所有內容,闡述相關的生命倫理、質量控製、標準規範等重點論題,並且從魚類樣本的采集、處理、儲存到基於樣本的核酸提取、序列分析等均有詳細的說明和指導,同時介紹魚類樣本庫配套的生物信息數據庫建設及模塊化解決方案,讓讀者對魚類樣本庫建設有一個全麵而深入的認識。
  作為“華大基因·國傢基因庫係列”叢書中的一本,《華大基因-國傢基因庫係列:後基因組時代魚類樣本庫建設與實踐》可作為深圳華大基因學院的研究生教材,也可供動物學、水生生物學、魚類學有關專業的高年級本科生、研究生及從事生物樣本庫和信息數據庫建設的相關學者參考使用。


目錄
前言

第*部分 魚類種質資源概述
第*章 我國主要水域的魚類資源現狀
第二章 魚類種質資源麵臨的主要問題及對策
第三章 魚類種質資源的應用前景

第二部分 魚類樣本庫建設沿革與發展現狀
第*章 生物樣本庫概述
第二章 傳統魚類樣本庫的建設概況
第三章 後基因組時代魚類樣本庫麵臨的挑戰
第四章 下一代測序技術催生組學級彆的樣本庫建設
第五章 組學級彆魚類樣本庫的建設概況及展望

第三部分 魚類樣本庫建設標準規範及zui佳實踐
第*章 倫理道德規範
第二章 樣本庫機構設置和人員培訓
第三章 標準規範製定
第四章 魚類樣本采集規範
第五章 魚類樣本解剖規範
第六章 樣本前處理
第七章 樣本製備
第八章 樣本儲存
第九章 樣本齣入庫管理
第十章 樣本包裝和運輸
第十一章 質量控製
第十二章 文件控製
第十三章 儀器管理維護
第十四章 安全管理

第四部分 配套生物信息數據庫建設
第*章 生物信息數據庫
第二章 國內外魚類信息數據庫
第三章 韆種魚轉錄組數據庫及網站建設

第五部分 模塊化解決方案
第*章 樣本野外采集模塊
第二章 運輸模塊
第三章 樣本庫模塊
第四章 魚類精子冷凍保存模塊
第五章 基因組學模塊

第六部分 依托Fish-TIK項目建設的魚類樣本庫和數據庫
第*章 Fish-TIK項目簡介
第二章 標準操作規程
第三章 Fish-TIK當前進展
第四章 Fish-TIK樣本庫及數據庫的應用及展望

附錄1 錶格錶單
附錄2 詞匯錶

在綫試讀
  《華大基因-國傢基因庫係列:後基因組時代魚類樣本庫建設與實踐》:
  第三章 標準規範製定
  1 製定標準規範的目的和意義
  隨著生命科學研究進入後基因組時代,我國在魚類基因組研究方麵所産生的數據信息也進入瞭急劇膨脹階段。但是,在魚類組織樣本收集、保存、利用等方麵尚存在諸多問題,如缺乏標準化、規範化、規模化管理和質量控製等,使得已收集保存的魚類組織未充分發揮應有的作用。此外,目前在魚類研究方麵,權**的、國**的信息共享平颱較為稀缺,各數據庫産生的數據關聯程度低、整閤性差,資源無法共享,在一定程度上阻礙瞭重大課題之間的閤作和交流。
  因此,我們擬訂此標準規範,供各魚類樣本庫建設單位參考與藉鑒,期望能有助於儲存和管理我國特有的魚類遺傳資源、生物信息和基因數據,為中國生命科學研究和産業發展提供基礎性和公益性服務平颱。該標準擬建設的樣本庫將區彆於傳統的、小規模魚類樣本庫,將采用魚類基因信息數據庫(簡稱“乾庫”)和魚類樣本資源庫(簡稱“濕庫”)相結閤的模式。“乾庫”匯集核酸和蛋白質數據信息,“濕庫”收集、整閤各類水生生物資源,包括魚類標本、組織、活體細胞等,並保存實體的DNA、RNA、蛋白質和小分子樣本等。這種既有數據又有實體的新一代基因資源庫、信息庫、知識庫和工具庫,與傳統的“乾濕分離”的基因庫相比,具有極大的産業和科研應用價值與極強的競爭優勢。
  本套標準根據實踐經驗總結,為樣本的規範化采集、儲存、運輸等提供瞭很好的依據。標準的製定和實施可幫助樣本庫提高其整體績效和能力,為組織的所有者、顧客、員工、供方、閤作夥伴和社會創造價值,有助於獲得長期的市場成功,並使各類樣本庫易於在質量管理實踐方麵進行溝通和共享。
  2 製定標準的基本原理
  中國標準化原理探討齣現瞭多種觀點,相互之間雖各有差異,但大傢普遍認為“統一”“簡化”“優選”“協調”為標準化的基本原理。鄺兵等通過總結標準化的傳統理論和現代標準化的發展趨勢,認為標準化的方法原理是簡化節約原理、統一效能原理、協調一緻原理、總體zui優原理、有效競爭原理。下麵分彆介紹。
  2.1 簡化節約原理
  桑德斯和鬆浦四郎關於標準化原理的論述中,均將簡化看成標準化首要的和基本的原理。標準化的規律錶明,簡化是標準化zui基本的手段,通過標準化可以減少需要標準化對象的復雜性,加強互聯互通和兼容性。然而同時需要注意,簡化的實質不是簡單化而是精練化,其結果不是單純的以少替多,而是在一定閤理性的範圍內,以少勝多。
  2.2 統一效能原理
  標準化的目的是要使復雜的事物達到統一,通過統一實現結構的優化,從而實現zui佳的經濟和社會效能。以保證事物發展所必需的秩序和效率為目的,對事物的形成、功能或其他特性,確定適閤於一定時期和一定條件的一緻規範,並使這種一緻規範與被取代的對象在功能上達到等效。
  2.3 協調一緻原理
  在標準係統中每一項標準都是一個基本的組成單元,它一方麵要受到係統的製約,同時又會影響整個係統功能的發揮。協調一緻原理就是為瞭使標準的整體功能達到zui佳,並産生實際效果,必須通過有效的方式協調好係統內外相關因素之間的關係,確定為建立和保持相互一緻,適應或平衡關係所必須具備的條件。
  2.4 總體zui優原理
  按照特定的目標,在一定的限製條件下,對標準係統的構成因素及其關係進行選擇、設計或調整,使其達到zui理想的效果,這樣的標準化原理稱為zui優化原理。在標準化的過程中,“總體zui優”的思想十分重要。一方麵,因為追求zui優化有助於實現zui佳效益,這符閤標準化的結果要求。另一方麵,標準化活動的zui優化,應從整體齣發,如果隻是從局部齣發,雖然貌似閤理,但從總體上說,製定的標準其適應性一定十分有限。
  2.5 有效競爭原理
  標準化的作用不僅是産品的簡化與節約、目標的統一與效能、過程的協調與一緻、功能的總體與優化,還在於發揮市場競爭中的行業準入規則作用。這正是經濟全球化下,標準化戰略作用的具體體現。首先,在市場經濟條件下,標準化已成為市場競爭的有效手段。標準的所有權意味著行業準入的規則和市場競爭的主動權,製定標準時,應重視話語權的爭奪。其次,要閤理運用國際國內標準化的規則,積極參與標準的製定,通過組成標準聯盟等形式實現標準的聯係與推廣,爭取更廣泛的支持,使標準的製定和實施更多地反映自身的利益。zui後,標準在競爭中的作用必須體現齣有效性。其含義是通過製定標準能使國傢、産業和企業搶占競爭的製高點,獲得應有的利益。
  ……
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