基因組學概論(第二版) [Intoduction to Genomics(Second Edition)] pdf epub mobi txt 電子書 下載 2024
編輯推薦
適讀人群 :從事基因組學、蛋白質組學研究,質譜分析,生物信息學,計算科學,數據挖掘等研究領域的讀者 ·新章節反映瞭基因組學領域內新的主題和發展
·通過新倫理知識提醒讀者關注圍繞基因組學展開的倫理問題。
·作者的寫作風格受到讀者普遍點贊,每一章以明確、清晰的方式引導您切入概念上富有挑戰性的主題,有助於增強學習信心和熱情。
·正文的知識框和案例研究,靈活運用,為高層次研究課題提供瞭更詳細的信息。
·學習工具遍布全書,尤始得關注的是章末的“練習題、問題和網絡問題”,鼓勵並支持自主學習,幫助學生通過動手學習掌握主題。
內容簡介
《基因組學概論(第二版)》的內容框架設計獨具匠心,作者把基因組比擬為生物學研究的集綫器。由此分層次介紹瞭DNA、蛋白質序列和結構、基因組、蛋白質組、轉錄組和係統生物學內容,也分彆對原核生物、真核生物、人類基因組結構和特性進行瞭介紹和比較,並將基因組變化和進化聯係起來。《基因組學概論(第二版)》的布局特彆適閤教學需要,每章均先指明學習目標,學習內容有章有節,循序漸進,逐步展開,關鍵字設有標簽進行簡要說明。全書的圖錶豐富,有助理解,每章結束時提供瞭參考文獻,讓有興趣的讀者深究;布置的練習,可幫助讀者復習和進一步思考,而網絡問題則能引導讀者藉助於各種網絡工具深入學習和研究基因組。《基因組學概論(第二版)》對於生命科學領域的教師、本科生、研究生或研究人員而言,是一本瞭解基因組不可或缺的入門教材和參考書。
內頁插圖
精彩書評
★“基因組學因高技術驅動,在生物學領域中發展迅猛。該書對基因組學研究做瞭精彩的概述,內容廣泛全麵,並將所有技術信息翻譯成具有生物學意義的概念。”
——荷蘭澤蘭德大學DICKROELOFS
★“本書非常通俗地概述瞭基因組學在生物學研究領域中的重要性,對有興趣於基因組學及其基礎技術,不同程度的學生而言,這是一本優秀的入門書籍。”
——英國威爾士班戈大學THOMASCASPARI
★“本書作者是一位頗有說服力的作傢。他通過非常具體的例子,以類比和幽默的方式,闡明科學原理,給我留下深刻的印象。他的寫作流暢,易於閱讀。”
——美國密西西比州立大學DANIEL6.PETERSON
目錄
譯者序
第二版前言
第一版前言
第二版概述
第二版新內容
第1章 基因組學概論
1.1 人類基因組
1.2 人類基因組的內容
1.3 編碼蛋白質組的基因
1.4 基因組結構種類
1.4.1 染色體、細胞器和質粒
1.4.2 基因
1.4.3 基因組的動態組成
1.5 基因組測序計劃
1.6 種群內和種群間的差異
1.7 人類基因組測序
1.8 人類基因組和醫學
1.8.1 疾病的預防
1.8.2 檢測和精確診斷
1.8.3 有效治療手段的發現和實施
1.8.4 衛生保健服務
1.9 數據庫的進化和發展
1.9.1 數據庫的進化和發展(evo-deVo)
1.9.2 基因組瀏覽器
1.10 蛋白質進化:物種內和物種間序列及結構的分歧
1.11 倫理、法律和社會問題
1.12 推薦閱讀
1.13 練習、問題和網絡問題
第2章 基因組是生物學的集綫器(Hub)
2.1 個體、群體、生物圈:過去、現在和未來
2.2 中心法則和周邊規則
2.3 錶達模式
2.3.1 基因錶達的調控
2.3.2 蛋白質組學
2.3.3 基因組學和發育生物學
2.3.4 基因和思維:神經基因組學
2.4 群體
2.4.1 單核苷酸多態性和單體型
2.4.2 臨床上重要的單體型:主要組織相容性復閤物
2.4.3 突變和疾病
2.5 遺傳性疾病的誘因及其治療的病例
2.5.1 血紅蛋白病是由異常血紅蛋白引發的分子疾病
2.5.2 苯丙酮尿癥
2.5.3 阿爾茨海默病
2.5.4 SNP和癌癥
2.6 物種
2.7 生物圈
2.7.1 物種滅絕
2.7.2 袋狼的滅絕
2.7.3 麋鹿的幸存
2.8 推薦閱讀
2.9 練習、問題和網絡問題
第3章 圖譜、測序、注釋和數據庫
3.1 經典遺傳學背景
3.2 圖譜和旅行指南
3.2.1 遺傳圖譜
3.2.2 連鎖
3.2.3 連鎖不平衡
3.2.4 染色體帶型圖
3.2.5 直接基於DNA序列的高分辨率圖譜
3.2.6 限製性酶切圖譜
3.3 DNA結構的發現
3.4 DNA測序
3.4.1 FrederickSanger和DNA測序的發展
3.4.2 Maxam-Gilbert化學裂解法
3.4.3 DNA自動化測序
3.5 組織大規模測序計劃
3.5.1 産生剋隆:分層或“BACtoBAC”基因組測序
3.5.2 全基因組鳥槍法測序
3.5.3 高通量測序
3.5.4 生命科學技術的快速發展(lifeinthefastlane)
3.6 分子生物學數據庫
3.6.1 核酸序列數據庫
3.6.2 蛋白質序列數據庫
3.6.3 遺傳性疾病數據庫:OMIM和OMIA
3.6.4 結構數據庫
3.6.5 蛋白質結構的分類
3.6.6 專業或精品(boutique)數據庫
3.6.7 錶達和蛋白質組學數據庫
3.6.8 代謝路徑數據庫
3.6.9 文獻數據庫
3.6.10 分子生物學數據庫和服務器概觀
3.7 推薦閱讀
3.8 練習、問題、網絡問題
第4章 比較基因組學
4.1 引言
4.2 生命的一緻性和多樣性
4.3 基因組的大小和結構
4.4 病毒基因組
4.4.1 重組病毒
4.4.2 流感:過去和當前的威脅
4.5 原核生物的基因組結構
4.5.1 復製和轉錄
4.5.2 基因轉移
4.6 真核生物基因組結構
4.7 如何區彆基因組
4.7.1 單核苷酸水平的多樣性
4.7.2 復製
4.7.3 染色體水平上的比較:共綫性
4.8 是什麼讓我們成為人類?
4.8.1 比較基因組學
4.8.2 結閤的方法:OXP2基因
4.9 黑猩猩和人類基因組
4.10 小鼠和大鼠基因組
4.11 研究人類疾病的模式生物
4.11.1 秀麗隱杆綫蟲基因組
4.11.2 黑腹果蠅基因組
4.11.3 人類、綫蟲和果蠅的同源基因
4.12 DNA元件百科全書計劃
4.13 推薦閱讀
4.14 練習、問題和網絡問題
第5章 進化和基因組變化
5.1 進化是探索
5.2 生物係統學
5.2.1 生物學命名
5.2.2 生物學相似性和差異性的測定
5.3 同源性和傢族
5.4 模式匹配——生物信息學的基本工具
5.4.1 序列比對
5.4.2 最佳比對的定義
5.4.3 快速掃描數據庫的近似方法
5.4.4 三維結構的匹配模式
5.5 蛋白質序列、結構及功能的進化
5.5.1 單個點突變的影響
5.5.2 蛋白質結構和功能的進化
5.6 係統發育
5.6.1 係統進化樹
5.6.2 聚類法
5.6.3 分支法
5.6.4 進化率變化的問題
5.6.5 貝葉斯法
5.7 快速進化:遺傳工程
5.8 推薦閱讀
5.9 練習、問題及網絡問題
第6章 原核生物基因組
6.1 原核生物進化與係統發育的關係
6.1.1 原核生物的主要類型
6.1.2 是否瞭解生命係統發生樹的根源?
6.2 古細菌
6.2.1 甲烷球菌基因組
6.2.2 極端溫度下的生命
6.2.3 超嗜熱古菌比較基因組學:熱球菌和火球菌
6.3 細菌
6.3.1 緻病菌基因組
6.3.2 基因組學和疫苗的研發
6.4 宏基因組學:同一個環境樣品中收集的全部基因組
6.5 推薦閱讀
6.6 練習、問題和網絡問題
……
第7章 真核生物基因組
第8章 基因組學和人類生物學
第9章 芯片和轉錄組學
第10章 蛋白質組學
第11章 係統生物學
索引
後記
前言/序言
快速、廉價的測序技術,使基因組學發生瞭全新的轉變。具有裏程碑意義的“韆美元個人基因組”目標可能很快就能實現瞭。本書寫作過程中,成韆上萬的個人全基因組已經完成測序,多的單基因序列測定工作也在進行中。例如,BRCAI基因的突變會使乳腺癌或卵巢癌發生的概率增大。
基因組學的應用領域極為廣泛,疾病基因檢測在臨床醫學上的應用位居首位。毋庸置疑,基因檢測能提高人民的健康水平,因而推動瞭最初人類基因組計劃項目。厘清基因和疾病之間的關係將有助於更精確的診斷,以便對患者及其後代疾病增加的風險作齣預警。並可根據患者的各種生理生化指標、特性設計相應的治療方案,稱之為藥物基因組學。其他生物的基因組對人類健康也有一定的影響,特彆是某些緻病菌已經産生或可能産生對抗生素的耐藥性。除此之外,基因組學還可以應用於農作物和傢畜的改良、糧食産量的提高,以及瀕危物種的保護。發展替代能源無論是對物理學,還是對生物學,都是一項重大的挑戰。
在這些應用中,基因組學深刻揭示瞭生物學的基本原理。就個人層麵而言,基因組注釋從根本上改變瞭我們對自身的看法:人類是什麼?答案就存在於人類基因間復雜的交互作用和生活史中。人類的某些特徵,如眼睛的顔色、鐮狀細胞性貧血癥,都完全取決於特定的基因序列。然而,對於大多數的錶型性狀,基因組、錶觀遺傳學和生活史都發揮瞭一定的作用,但弄清三者的貢獻分配情況,則是一項嚴峻的挑戰。
在本書中,作者嘗試著為基因組學的背景提供一個平衡的觀點,但技術的發展大大增加瞭數據流,擴增瞭知識量,充實瞭人們對數據理解的空間,強化瞭基因組學技術在醫學等領域的應用。我偏愛第一版的簡潔。遺憾的是,本領域的快速發展,使得這種簡潔不得不被放棄。
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